MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	TAACTT	2	12	38	49	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_001853	ATA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001853	T	8	8	162	169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001853	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001853	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001853	ATT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001853	TTA	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001853	AAT	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001853	A	6	6	367	372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001853	T	8	8	903	910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001853	A	8	8	929	936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001853	A	7	7	939	945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001853	A	6	6	963	968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001853	ATA	2	6	980	985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001853	AAC	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_001853	A	6	6	1373	1378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001853	AT	3	6	1424	1429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001853	ATAA	2	8	1439	1446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001853	TA	3	6	1695	1700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001853	TTAT	2	8	1729	1736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001853	TAAAC	2	10	1758	1767	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_001853	TTC	3	9	1791	1799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_001853	TA	4	8	1843	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001853	AAG	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001853	GA	3	6	1868	1873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001853	TAT	2	6	1908	1913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001853	T	6	6	1921	1926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001853	AAAG	2	8	1931	1938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001853	AGT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001853	AG	3	6	1986	1991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001853	TA	3	6	2045	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001853	AAT	2	6	2054	2059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001853	T	6	6	2061	2066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001853	TAA	2	6	2071	2076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001853	ATT	2	6	2091	2096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001853	T	6	6	2095	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001853	TAG	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001853	CT	3	6	2213	2218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_001853	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001853	TA	3	6	3073	3078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001853	T	6	6	3079	3084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001853	A	7	7	3085	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001853	ATTA	2	8	3122	3129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001853	TC	3	6	3131	3136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_001853	T	8	8	3155	3162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001853	T	7	7	3172	3178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001853	TA	3	6	3199	3204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001853	A	6	6	3207	3212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001853	T	6	6	3276	3281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001853	TAA	2	6	3283	3288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001853	A	7	7	3302	3308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001853	TCA	2	6	3353	3358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_001853	GAT	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001853	A	6	6	3420	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001853	A	6	6	3429	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001853	ATT	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001853	AAT	2	6	3449	3454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001853	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001853	A	6	6	3485	3490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001853	ATT	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001853	AAGA	2	8	3518	3525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001853	ATC	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_001853	TA	3	6	3623	3628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001853	GTAA	2	8	3630	3637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001853	ACCA	2	8	3722	3729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_001853	ATT	2	6	3761	3766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001853	T	6	6	3785	3790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001853	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001853	TCA	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_001853	TAA	3	9	3842	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001853	TTAT	2	8	7733	7740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001853	CTT	2	6	7756	7761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_001853	T	7	7	7789	7795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001853	A	7	7	7802	7808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001853	ATTT	2	8	7846	7853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001853	ATT	2	6	7893	7898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001853	AATT	2	8	7913	7920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001853	TTA	2	6	7925	7930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001853	ATTT	2	8	7931	7938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001853	T	6	6	7936	7941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001853	TTAA	2	8	7953	7960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001853	A	6	6	7970	7975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001853	T	6	6	7979	7984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001853	T	6	6	8449	8454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001853	TTAA	2	8	8568	8575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001853	ATT	2	6	8583	8588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001853	TA	4	8	8626	8633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001853	TCT	2	6	8652	8657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_001853	T	6	6	8683	8688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001853	AAT	2	6	8705	8710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001853	TAAA	2	8	8734	8741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001853	T	8	8	8763	8770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001853	A	6	6	8777	8782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001853	ATG	2	6	8825	8830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001853	CAA	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_001853	TAA	2	6	8870	8875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001853	T	7	7	8885	8891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001853	T	6	6	8899	8904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001853	TAAT	2	8	8973	8980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001853	T	6	6	8980	8985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001853	ACT	2	6	9026	9031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_001853	AGT	2	6	9058	9063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001853	TCA	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_001853	TA	3	6	9248	9253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001853	TAAA	2	8	9261	9268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001853	ATA	2	6	9310	9315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001853	AT	3	6	9318	9323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001853	T	6	6	9323	9328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001853	TTC	2	6	9335	9340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_001853	TA	3	6	9354	9359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001853	A	6	6	9368	9373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001853	ATA	2	6	9437	9442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001853	ATT	2	6	9466	9471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001853	GAT	2	6	9520	9525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001853	AGATT	2	10	9605	9614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001853	AAT	2	6	9685	9690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001853	ACT	2	6	9714	9719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_001853	A	8	8	9722	9729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001853	T	7	7	9805	9811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001853	TGAATA	2	12	9818	9829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001853	A	6	6	9829	9834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001853	TCAC	2	8	10520	10527	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_001853	CTA	2	6	10528	10533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_001853	TA	5	10	10532	10541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001853	CA	3	6	10608	10613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_001853	AT	3	6	10620	10625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001853	TTA	2	6	10668	10673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001853	A	7	7	10706	10712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001853	TTTAT	2	10	10713	10722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001853	TA	3	6	10743	10748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001853	ATA	3	9	10746	10754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001853	ATT	2	6	10762	10767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001853	AAAGCT	2	12	10774	10785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_001853	TGA	2	6	10804	10809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001853	TAA	2	6	10859	10864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001853	ATA	2	6	10935	10940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001853	ACT	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_001853	GCTTT	2	10	11014	11023	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_001853	T	8	8	11025	11032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001853	A	6	6	11033	11038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001853	TCTA	2	8	11040	11047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_001853	CTT	2	6	11072	11077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_001853	T	7	7	11082	11088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001853	T	7	7	11097	11103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001853	ATC	2	6	11171	11176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_001853	ATTTT	2	10	11198	11207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001853	A	7	7	11247	11253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001853	ATT	2	6	11316	11321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_001853	ATT	2	6	11335	11340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_001853	TAT	2	6	11356	11361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001853	T	7	7	11361	11367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001853	A	6	6	11437	11442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_001853	GCT	2	6	11481	11486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_001853	T	6	6	11641	11646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_001853	CTA	2	6	11678	11683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_001853	TTTA	2	8	11684	11691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_001853	TCT	2	6	11792	11797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_001853	TTTC	2	8	11808	11815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_001853	TTATAT	2	12	12076	12087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_001853	T	6	6	12139	12144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_001853	A	7	7	13184	13190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_001853	TTTA	2	8	19973	19980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_001853	TAA	2	6	19991	19996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_001853	ATA	3	9	20032	20040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_001853	TTG	2	6	20062	20067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_001853	A	7	7	20188	20194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_001853	CAT	2	6	20263	20268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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321	NC_001853	T	6	6	20568	20573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_001853	TAATT	2	10	20592	20601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_001853	T	7	7	20622	20628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_001853	TG	3	6	21181	21186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_001853	ATA	2	6	21432	21437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_001853	T	7	7	24772	24778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_001853	TTC	2	6	24792	24797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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437	NC_001853	ATT	2	6	24905	24910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_001853	ATA	2	6	24918	24923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_001853	AAT	2	6	25003	25008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_001853	T	6	6	25020	25025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_001853	GATAAA	2	12	25033	25044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_001853	AAAAT	2	10	25049	25058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_001853	A	6	6	25064	25069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_001853	T	6	6	25070	25075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_001853	GCT	2	6	25131	25136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_001853	AGA	2	6	25168	25173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_001853	ATT	2	6	25202	25207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_001853	A	6	6	25248	25253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_001853	T	7	7	25320	25326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_001853	AG	3	6	25365	25370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
454	NC_001853	TCT	2	6	25371	25376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_001853	AGA	2	6	25382	25387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_001853	T	6	6	26483	26488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_001853	TTA	2	6	26491	26496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_001853	A	7	7	26783	26789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_001853	A	6	6	26791	26796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_001853	A	7	7	26810	26816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_001853	ATT	2	6	26901	26906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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